Cynthia_Shih Cynthia_Shih - 魔方O-MF241043 综合讨论组

魔方数据上传微基因并转成23andMe格式后,无法上传GEDmatch

导入的是魔方中通原始数据,之后下载微基因核心数据,用http://joshua.galaxy.42dna.com/wgto23/这个转换器转成23andMe V5格式,然后上传到GEDmatch匹配亲缘关系,数据分析一段时间后报错Percent HTZ out of range,血统计算器倒是可以跑。

有没有哪位大佬知道这个报错怎么解决,是魔方导入的问题还是转成23andMe格式的问题?我试着查到了几个人给出的说法,比如
https://anthrogenica.com/showthread.php?18892-Percent-HTZ-out-of-range-Gedmatch
https://forums.gedmatch.com/BB/viewtopic.php?t=847
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6992384/#bib55

我自己的理解是,这个报错的意思是杂合等位基因位点(一个位点A和T都有之类)过多,因为有人可以故意制造有很多这种位点的数据,把数据库中很多用户都匹配出并查看其个人信息。

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2021-08-05 • IP属地扬州
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3 个回复

Cynthia_Shih - 魔方O-MF241043
捕获.PNG

 
格式转化次数越多,有效数据就越少,建议你直接上传魔方数据到gedmatch看看
Cynthia_Shih - 魔方O-MF241043
魔方原始数据上传也不行,导入微基因后转成微基因格式的数据上传是可以的,再转成23andMe格式又不行了

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