近视的SRY基因 祖源分析

我的mt是不是匹配错了?

捕获.PNG

如图,目前wegene给出的是M71c,但从算法来讲,还是M71a1a最有可能吧。151那里只有这一个位点供判断,下游全是+,所以151假-或发生回复突变的可能性较大:反观M71c那里只有1个点是+,不太靠谱。
 
#图里绿色的是+,灰色的是-,画圈的是未检测
2016-03-26 • IP属地中国
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2 个回复

wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
没有公认的算法其实是因为mt谱系树的构建是基于已有样本,跟据已有样本的突变来摸索谱系上下游关系,但mt的特点是突变率较高,所以你会发现越到下游越复杂,有的情况下是只有一个样本就能定义一个下游支系,那就可以理解为什么自己的突变和已有树形不是完全匹配。
 
你的情况更可能是M71a1a,因为T195C!是一个高变区位点,本身突变率就远高于编码区,所以很可能是你在M71a1a的基础上自己又突变出了195这个位点。
 
上述讨论是基于数据完全正确的情况。也不排除你的195位点突变仅是数据质量不佳造成的。
费力科思 - WeGene勤杂工
没有公认的算法,我们也在头疼。
 
我们正在做类似的,但交互性更好的Y和MT的可视化,让用户可以自己看到具体的匹配情况,以及我们的算法推荐的匹配路径。

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