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谦和的MSH2基因
痛风
怎么rs2231142这个点位完全翻转了?
之前的结果是rs2231142基因型对于痛风非常高风险
但是现在又变成了低风险?
2016-08-15 • IP属地中国
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zhengqiang
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勤奋学习
随着我们实验数据的不断增加,原始数据会做多次重复的分析,因此会有少量位点会有一些改变,但是每次改变的结果都会让数据本身更加趋向真实。
pds1990
痛风项目也确实在近期做了一些调整,调整的主要是位点rs150414818;
这个位点之前在少数批次中出现了频率分布和已知数据库不符的情况,因此进入了我们的监控范围,但本着尊重数据的态度,我们并没有直接改变原始数据;随着我们数据库中国人群数据的增加,我们的数据分析流程也在不断完善,也会适时调整了一些分析参数;
经过改进,rs150414818的检测质量得到了显著的提升,目前该位点两种可能碱基C:G的比例为10:0,这与千人数据库中的东亚人群(EAS),以及中国汉族人群(CHB/CHS)比例是相符合的(
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/snp_ref.cgi?searchType=adhoc_search&type=rs&rs=rs150414818
);
而您提到的rs2231142位点的检测结果还是相对较好的,该位点两种可能碱基A:C的比例一直维持在3:7左右,与千人数据库中的东亚人群(EAS),以及中国汉族人群(CHB/CHS)比例是一致的(
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/snp_ref.cgi?searchType=adhoc_search&type=rs&rs=rs2231142
);
随着我们数据量的增加,那些在中国人群中不易检测的位点的检测效果是会不断改进的,同时我们也会及时更新我们的数据和报告;
感谢您对WeGene的支持!
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痛风
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这个位点之前在少数批次中出现了频率分布和已知数据库不符的情况,因此进入了我们的监控范围,但本着尊重数据的态度,我们并没有直接改变原始数据;随着我们数据库中国人群数据的增加,我们的数据分析流程也在不断完善,也会适时调整了一些分析参数;
经过改进,rs150414818的检测质量得到了显著的提升,目前该位点两种可能碱基C:G的比例为10:0,这与千人数据库中的东亚人群(EAS),以及中国汉族人群(CHB/CHS)比例是相符合的(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/snp_ref.cgi?searchType=adhoc_search&type=rs&rs=rs150414818);
而您提到的rs2231142位点的检测结果还是相对较好的,该位点两种可能碱基A:C的比例一直维持在3:7左右,与千人数据库中的东亚人群(EAS),以及中国汉族人群(CHB/CHS)比例是一致的(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/snp_ref.cgi?searchType=adhoc_search&type=rs&rs=rs2231142);
随着我们数据量的增加,那些在中国人群中不易检测的位点的检测效果是会不断改进的,同时我们也会及时更新我们的数据和报告;
感谢您对WeGene的支持!
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