科学分析DTC基因检测为什么假阳性特别高

最近权威期刊发表DTC基因检查（类似23andme, 微基因, 23魔方等等)的突变假阳性高达40%。
https://www.nature.com/articles/gim201838

现在我告诉你为啥这个可能是真的。

首先突变多数是发生率极低的那种，类似于几千到几十万分之一。

做医生的人选择检查时往往会去了解一个检查项目的敏感性、特异性。很多医生朋友把这个数值看做是检验的预测值。虽然说，理论上检查的敏感性和特异性越高，该检查的预测价值越大。但很可惜的是，如果患者的检验前概率很低，哪怕该检查的理论敏感性和特异性达到99%，该检查也不具有很高的预测性。

假阳性率=假阳性数量/(假阳性数量+真阴性数量)。它也等于1-特异性。根据上面CT假设的特异性，可知假阳性率是1%。

假阴性率=假阴性数量/(假阴性数量+真阳性数量)。它也等于1-敏感性。同上所述，可知假阴性率是1%。

中国的近年来的数据显示，中国的男性肺癌发病率约为10万分之50。假设高分辨率CT的敏感性和特异性都达到99%。那么一个人做高分辨率CT的结果是阳性的，请问，你有多大把握认定他是肺癌呢？

我们首先来看阳性预测值，即CT发现有问题的人里有多少是肺癌的。我们知道10万人里有50个是肺癌，那么真阴性人数是99950人。假设假阳性人数是X，则为X/(X+99950)=1%,求X≈1009.6，也就是说在检验前概率只有10万分之50的情况下，你做完CT，会有1009个左右的假阳性肺癌人数----他们不是肺癌，却被你怀疑是肺癌。而这其中其实约只有50个人是肺癌。这里面仅仅约4.9%的人是肺癌。

再看看阴性预测值呢？即CT发现没问题的人里有多少是真正无肺癌的。我们知道真阳性人数是50个人，那么计算数值是X/（X+50）=1%，X≈0.505。也就是说，在检验前概率只有10万分之50人的情况下，你做完CT，会有0.5个人是假阴性肺癌----他们是肺癌却被你认为不是肺癌。他的阴性预测值是99.999%。也就是说，在这个情况下，CT检查是阴性，你可以很肯定的告诉他几乎不可能是肺癌。

我们发现一点，这种很低概率的疾病下，哪怕检查非常好，如果你是阳性的，也不能证明你有这个病，但如果检查是阴性的，倒是可以肯定你没这个病。

好了，现在假设微基因的基因检测敏感性和特异性达到99.9%，某种罕见遗传病发病率是万分之一，那么微基因３０万用户应该有３０个病人，那么真阴性人数是２９９９７０人。假设假阳性人数是X，则为X/(X+２９９９７０)=0.1%,求X≈300，好了结果３００个基因检测阳性的结果真正患病的只有３０个。

结论：对于罕见突变的遗传病，即使某基因检测有很高的特异性，如果你是阳性的，也不能证明你有这个病。