ctlbj 祖源分析

Phasing是不是能使祖源成分分析更准确？

最近我在23andMe测了我孩子的DNA。当23andMe将我们的数据作了phasing以后，对我们的祖源成分分析进行了相当大的修改。据该公司讲，phasing会提高祖源成分分析的准确性。WeGene也有计划应用phasing吗？

2016-04-11 • IP属地美国

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费力科思 - WeGene勤杂工

Phasing有助于在算法层面让组员成分分析更准，我们会朝这个方向去努力。计算量很大，对参考数据集也有要求。

现在，如传超所说，现在起更大作用的是参考数据库。WeGene现在用的也都是公开发表的样本数据，文档我们还在整理。暂时没有用到古人类的数据。

东亚人群的古人类DNA数据几乎木有，如果有合适的古代人基因组数据出来，我们应该会提供相关的分析并设计相关的产品。

ctlbj

谢谢！我对你们与顾客交流的透明度非常赞赏。

wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后

看祖源分析的尺度，当祖源分析要细化到中国各民族的时候，主要瓶颈就是人群近期混合所造成的“同质性”，也就说我们难以找出足够的族群特异位点来进行非常精细的祖源识别，而这不是phase可以有效解决的。

wang - 哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后

另外，祖源分析的精准与否很大程度上取决于所使用的参考数据库：
1. 如果参考数据只有现代人群，那么很难搞清楚谁是“源”谁是“流”；
2. 引入古代人群作为参考数据，可以在一定程度上帮助解决上述基因流向问题，使祖源辨析更准确。

23andme的参考数据库并没有涵盖东亚人群，所以其祖源分析在东亚的解析度很低

ctlbj

你的说明意思，谢谢。WeGene现在用古人的样本查“源”吗？你说的“流”是指外来人群加入到原有的本地人群，还是指本地人群随着时间有遗传变异？DNA.LAND刚刚把他们的祖源成分分析细化了，还列出了每个分类的参考人群，好像都是公开发表的样本。WeGene在参考人群的样本上应比他们有优越的地方。是不是还在不断地开发新的参考人群的样本？

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