Cccmm002 Cccmm002 乐观倾向

rs25531的结果是否可靠?

1. SNPedia上有这么一句:“23andMe reports that this genotype is not reliable on their platform. 23andMe users should ignore this result.”那么WeGene的如何?
 
2. WeGene的报告中只有标题一行,乐观倾向。然而这一位点似乎大有研究,有很多研究结果,希望能尽快添加相关说明;
 
3. SNPedia和OpenSNP上说的CC型是不是就是(-;-)型?
2016-04-15 • IP属地中国
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5 个回复

SNPedia中的GG就是dbSNP中的CC,dbSNP中已经明确标注了REV(基因型是受位点提交组织确定的,“此位点位于minus链”,其实是提交组织用了ref的互补链作为参考并提交。为什么会出现这种情况呢?只能说老外搞得数据库也就那样,到了一定程度,他们也很乱,几大主流数据库之间有差异很正常。)dbSNP注明的是该位点有两种allele,不是2种genotype~~~,genotype和allele有啥区别是不是你理解的不清楚呢?
1. 我们芯片这个位点的"GG"基因型频率为 27.33,没有出现类似23andme的极端异常的情况;
2. 项目的优化升级一直在进行,包括本项目,还请关注;
3. SNPedia中(-;-)一般指Delet, dbSNP也表明此位点只有2种Allele—A/G,由于此位点位于minus链,所以SNPedia和OpenSNP、以及某些文献中提及的CC型,很有可能是GG型;
 
 
我觉得我是矛盾体,我得了三次抑郁症,但是我不抑郁的时候还挺乐观的。。。
我从有记忆开始就是特别悲观的人,可是基因显示的是乐观。
监听员1379 - 10级大佬 Dr. Z
目前微基因有三个关于这个位点的微解读,
https://www.wegene.com/crowdsourcing/details/301
https://www.wegene.com/crowdsourcing/details/88​ 
https://www.wegene.com/crowdsourcing/details/378​ 
 
结果都是CT比例特别低,不符合a^2:2ab:b^2的比例,而各大数据库里测序的结果都应该是CC最低,且符合a^2:2ab:b^2的比例。
 
所以这个位点的微基因芯片结果大概率是有问题的。

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