使用本网站需要启用 JavaScript, 请启用后刷新页面获得更好的体验
登录
注册
首页
个人基因检测
临床应用研究
科研合作项目
合作与服务
社区
研究所
微解读
应用
姓氏祖源
基因关系
原始数据
纯合片段
使用 WeGene 需要启用 Cookies, 请启用后刷新页面获得更好的体验
社区首页
祖源讨论区
讨论详情
爽朗的USH2A基因
祖源分析
为什么K12B的分析和这里的大不同?
2016-08-14 • IP属地郑州
与内容相关的链接
提交
按热门排序
按默认排序
6 个回复
wang
-
哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
K12b分析结果的问题:
K12b的原理是根据位点的频率差异在模拟出12个祖先群体作为参考群体,然后将某样本的数据与这12个构想的参考群体进行比较。East Asian这一分类对应的是100%的日本人和80%左右的韩国人,可以说K12b是用日韩来代表“East Asian”;“Southeast_Asian”对应的则是傣族和越南人。
East_Asian 66.33%
Southeast_Asian 25.56%
可以这样理解,K12b把你的祖源分解为66.33%的日韩成分+25.56%的(傣和越南人)。
K12b也把汉族(Han)分解为55.2%的日韩+44.8%的(傣和越南人),所以在K12b里你得不到汉族祖源成分,而是笼统的“East Asian”,这个“East Asian”的参考人群是日本人。为什么日本人会被这类算法认为是祖先参考人群哪?因为日本人里有古老的绳文人遗传混合,绳文人是在至少1.2万多年前就与其他东亚群体分开的古老人群,有着与现有东亚人群不同的遗传背景。这就造成了现有东亚人群的遗传多样性无法涵盖日本人,也就造成了日本人是祖先群体的假象。
WeGene是把北方汉族和南方汉族设定为祖先群体来看某样本的遗传归属,某汉族样本自然就和北方汉或南方汉更近而不是和日本人更近了,所以会有您祖源中的北方汉族成分。
WeGene原始数据导入Gedmatch之后出现非洲成分:
首先请放心,您没有非洲成分,非洲人群对于东亚来讲是个遗传学上的外类群,近几万年没有基因交流。
WeGene原始数据会出现非洲成分可能是因为极少量的探针是没有confirmed过的,1%-2%的位点可能是有问题的,这些有问题的位点在东亚人群中是没有的,会被认为是来自非洲的、中东的等等。可以把未验证的探针得出的位点剔除掉,看还有没有奇怪的非洲成分。
聪明的SNTG1基因
我在WeGene,23&me和Ancestry都测了,而且把三套数据都上载到了GEDmatch。用WeGene数据得到的结果与用另外两个公司的数据得到的结果有明显的不同,主要是23&me和Ancestry的数据都不显示有任何African成分。用WeGene数据得到的Dodecad World9结果如下:
East_Asian 76.69
Siberian 19.62
African 1.59
Atlantic_Baltic 1.2
Caucasus_Gedrosia 0.67
Southern 0.18
Amerindian 0.05
私奔的RBMS3基因
的确如此~ 我也出现非洲成分了~
聪明的SNTG1基因
@wang
谢谢你的解释!
唱歌的1号染色体
我的非洲都超过3了。没啥了,组团找非洲亲戚好了
shuer
-
一句话介绍
可能是老祖宗几万年前从非洲迁来时带过来的非洲血统的残留吧
要回复问题请先
登录
或
注册
发起讨论
祖源分析
3877 个讨论
6 个回复
K12b的原理是根据位点的频率差异在模拟出12个祖先群体作为参考群体,然后将某样本的数据与这12个构想的参考群体进行比较。East Asian这一分类对应的是100%的日本人和80%左右的韩国人,可以说K12b是用日韩来代表“East Asian”;“Southeast_Asian”对应的则是傣族和越南人。
East_Asian 66.33%
Southeast_Asian 25.56%
可以这样理解,K12b把你的祖源分解为66.33%的日韩成分+25.56%的(傣和越南人)。
K12b也把汉族(Han)分解为55.2%的日韩+44.8%的(傣和越南人),所以在K12b里你得不到汉族祖源成分,而是笼统的“East Asian”,这个“East Asian”的参考人群是日本人。为什么日本人会被这类算法认为是祖先参考人群哪?因为日本人里有古老的绳文人遗传混合,绳文人是在至少1.2万多年前就与其他东亚群体分开的古老人群,有着与现有东亚人群不同的遗传背景。这就造成了现有东亚人群的遗传多样性无法涵盖日本人,也就造成了日本人是祖先群体的假象。
WeGene是把北方汉族和南方汉族设定为祖先群体来看某样本的遗传归属,某汉族样本自然就和北方汉或南方汉更近而不是和日本人更近了,所以会有您祖源中的北方汉族成分。
WeGene原始数据导入Gedmatch之后出现非洲成分:
首先请放心,您没有非洲成分,非洲人群对于东亚来讲是个遗传学上的外类群,近几万年没有基因交流。
WeGene原始数据会出现非洲成分可能是因为极少量的探针是没有confirmed过的,1%-2%的位点可能是有问题的,这些有问题的位点在东亚人群中是没有的,会被认为是来自非洲的、中东的等等。可以把未验证的探针得出的位点剔除掉,看还有没有奇怪的非洲成分。
赞同来自: william0509 、hum 、magix
East_Asian 76.69
Siberian 19.62
African 1.59
Atlantic_Baltic 1.2
Caucasus_Gedrosia 0.67
Southern 0.18
Amerindian 0.05
赞同来自: 蓝星旗
赞同来自:
赞同来自:
赞同来自:
赞同来自:
要回复问题请先登录或注册